伴随2014年上海高考考试改革策略的颁布，学校怎么样推行“6选3”来推进学校教育教学改革，推行个性化学程和学分制管理，对很多学校都是一个严峻的挑战。据校长王洋介绍，曹杨二中在原有基础上，归并相应教研组和学生社团组建“书院”式的“大学科组”，试行“年级+书院”的经纬组织构造，打造学生二次选择机制，为学生提供合适自己进步的课程群组，促进学生全方位而有个性地进步。
曹杨二中借鉴古时候书院的形式，纳入“生涯规划指导”和“现代学科进步介绍”等课程，以讲坛和研讨等研究型学习形式，拓展相应的社团活动和社会实践，辅之以“学长制”、“流动制”、“导师制”，使高中一年级新生从进校开始到高中二年级结束能初步确定我们的选科方向，随后进入“走班学习”，顺利解决高考考试改革中“6选3”的教学组织难点。
王洋表示，曹杨二中在2014年9月开始试行“年级+书院”的经纬组织构造，组成独具特点的5大书院体制：博雅文理书院、国际理工书院、科技革新书院、艺体塑身书院和文杰君子书院。在每个书院都有高选择性的课程设置：分类课程、社会实践活动课程、近50门拓展型和研究型课程、30多个学生社团，丰富的课程设置和活动给了学生最大的学习自主权。学生在初选后可流动、可调整。
“今年大家的自主招生，将结合5大书院的培养目的，在一个可以参照的考试成绩的基础上，设计不一样的面试形式。”王洋说，如博雅文理书院，在面试时侧重考查学生的关注人文素养和社会实践活动中学术能力；“国际班”融合国际课程，在数学、理化等基础型课程中增加了理工基础内容，开设了“CAD机械制图”、“工程实验”等工程特点课程；“科技革新书院”侧重考查学生的科技革新能力；“艺体塑身书院”致力于培养艺术体育专长生等。因此，曹杨二中既招收文理相通全方位进步的全才，也招收学有专长术有专攻的偏才。
